Etiopatogenezę coraz większej liczby chorób zaczynamy przypisywać zaburzeniom składu mikroflory jelitowej, czyli tzw. dysbiozie. Niewłaściwy skład flory bakteryjnej jelit może mieć wpływ na rozwój chorób alergicznych, na częstsze infekcje czy też występowanie dolegliwości trawiennych i chorób przewodu pokarmowego. Choć jeszcze wiele badań jest potrzebnych, aby odkryć rolę poszczególnych szczepów bakterii w etiologii poszczególnych schorzeń, wiemy już, że stosowanie probiotyków może złagodzić m.in. objawy IBS.